Margus Lopp on Tallinna Tehnikaülikooli orgaanilise keemia professor. Ta on avaldanud üle 200 teaduspublikatsiooni (sh 119 teadusartiklit) ja tal on neli patentset leiutist ning mitmeid NSVL autoritunnistusi. Teaduspreemiad ja -tunnustused: Eesti NSV teaduspreemia 1987. aastal prof. Ülo Lille juhitud teadusgrupis töö „Prostanoidide süntees, uurimine ja rakendused“ eest; Eesti teaduspreemia 2004. aastal teema juhina „Uued asümmeetrilised reaktsioonid ja nende katalüsaatorid“ eest; 1986. a. Moskva Rahvamajanduse Saavutuste Näituse hõbemedal uute prostaglandiinide analoogide eest; 2009. a. Valgetähe IV klassi orden ja 2009. a. TTÜ teenetemedal „Mente et manu“.

Jooksvad projektid: Keemilise Bioloogia Tippkeskus, orgaanilise sünteesi suund (3.2.0101.08-0017. EU Foundation of Regional Development, Eesti Haridus- ja Teadusministeerium); sihtfinantseerimise teema „Asümmeetrilise sünteesi uued strateegiad ja meetodid“ (SF0142725s06, Eesti Haridus-ja teadusministeerium, 01.01.06 – 31.12.11).